سنت و سکولاریسم، موسسه فرهنگی صراط، سال ۱۳۸۱
در این کتاب مجموعه‌ای از مقالات نواندیشان دینی (عبدالکریم سروش، محسن کدیور، محمد مجتهد شبستری، و مصطفی ملکیان) گرد آمده است. از آقای ملکیان عناوین مقابل در این مجلد موجود است: “سکولاریسم و حکومت دینی”، “معنویت گوهر ادیان”، “پرسش‌هایی پیرامون معنویت”.
در رهگذار باد و نگهبان لاله (۲ جلد)، انتشارات نگاه معاصر، ۱۳۹۴
این دو کتاب مجموعه‌ای از سخنرانی‌های آقای ملکیان پیش از سال ۱۳۸۲ را شامل می‌شود.. جلد اول شامل ۱۹ سخنرانی از ملکیان است که عناوین برخی از آنها عبارتند از: “دینداری در عصر جدید”، ” دینداری در دنیای معاصر”، “مشکلات تعلیم و تربیت دینی در جهان امروز”، “دین و بحران معنا در جهان جدید”، “تدین متعقلانه “، “عقلانیت”، “سنت و تجدد در جهان متغیر”، “معنویت و انسان متجدد”، “ویژگیهای انسان معنوی”، ” زندگی اصیل: جستاری فلسفی-اخلاقی”، “زندگی اصیل و مطالبه دلیل”.
جلد دوم شامل ۲۵ سخنرانی با این عناوین است: ” انسان‌شناسی و چند پرسش”، “اگزیستانسیالیسم”، “عشق، تنهایی، و سکوت”، “پشت پنجره دیگران بایستیم و شهر را دیگرگونه ببینیم”، “اصلاح فرد و بهسازی آینده”، “هویت و معنویت ایرانی در قرن بیست و یکم”، “تاثیر دین بر منش آدمی”، “ایمان و کارکردهای شریعت”، “الگوهای ارتباطی علم و دین”، “طبقه‌بندی شبهات دینی”، “بایسته‌های حوزه دین‌پژوهی”، “مشکلات اجتماعی ناشی از فهم نادرست دین”، “اصلاح‌گری در دین به چه معناست؟ “، “آیا ایدئولوژیک شدن دین ممکن و مطلوب است؟ “، “نسبت دین و سیاست”، “معناداری حکومت دینی”، “فلسفه فقه”، “حسین بن علی: قدیس و قهرمان اخلاقی”، “آرای اخلاقی و سیاسی مک‌اینتایر”.
راهی به رهایی: جستارهایی در عقلانیت و معنویت، انتشارات نگاه معاصر، ۱۳۹۶
این کتاب مجموعه‌ای از ۲۵ مقاله و نوشته است که در راستای پروژه عقلانیت و معنویت نگارش یافته‌اند. در این کتاب راجع به ارتباط اسلام و لیبرالیسم سخن به میان می‌آید. همچنین راجع به گفتگوی تمدنها، ارتباط علم و دین، عقلانیت و دین، ارتباط سنت و تجدد و تجربه دینی نیز صحبت شده است. عناوین برخی مقالات به ترتیب روبروست: “داده‌های وحیانی و یافته‌های انسانی”، “تاملاتی چند درباب امکان و ضرورت اسلامی شدن دانشگاه”، “علم دینی”، “سخنی در چندوچون ارتباط اسلام و لیبرالیسم”، “ارتداد”، “مبانی نظری مدارا”، “گفتگوی تمدنها: تجمل یا ضرورت فرهنگی”، “شناخت در قرآن”، “دین و دینداری در جهان معاصر”، “دفاع عقلانی از دین”، “دین و عقلانیت”، “انتظار بشر از دین”، “تجربه دینی”،، “کلام در روزگار ما”، “سنت و تجدد”، “نقد شووان بر فلسفه‌های جدید”.
تقدیر ما تدبیر ما، انتشارات نگاه معاصر ،۱۳۹۳
این کتاب شامل مجموعه‌ای فصول و گفتارهاست که پیرامون اصلاح‌طلبی و مبانی آن بحث می‌کند. در مقدمه کتاب ذکر شده که در ایام قدیم، رسم بود که آدمی تن به تقدیر بدهد و از آن زیاد شکایت نکند. رویکردهای رواقی و رندانه در گذشته رواج داشته‌اند و بر رضایت درونی، شادی، بهره بردن از لحظه و بی‌تفاوتی نسبت به گردش دوران تاکید می‌کرده‌اند اما در عصر مدرن انسان زمام امور را خود بر عهده گرفته و تلاش در جهت اصلاح وضع دارد. هراندازه که در عهد قدیم، تقدیر اهمیت داشت امروزه تدبیر انسانی نقش دارد.
حدیث آرزومندی: جستارهایی در عقلانیت و معنویت، انتشارات نگاه معاصر، ۱۳۸۹
شانزده مقاله‌ای که در این کتاب گرد آمده‌اند در فاصله سالهای ۱۳۸۱ تا ۱۳۸۷ نوشته شده و تحت دو بخش «عقلانیت» و «معنویت» تقسیم شده‌اند. در بخش مربوط به عقلانیت، راجع به نسبت فلسفه و دموکراسی و تقدم هریک بحث شده، همچنین مطالبی درباره اعلامیه نودوپنج ماده‌ای لوتر و آنسلم قدیس ارائه شده. در بخش مربوط به معنویت، جایگاه آیریس مرداک در علم اخلاق روزگار ما تبیین شده و همچنین مطلبی راجع به سیمون وی نیز ارائه شده است.
مشتاقی و مهجوری: گفت وگوهایی در باب فرهنگ و سیاست، انتشارات نگاه معاصر، ۱۳۸۵
این کتاب شامل مجموعه مصاحبه‌ها و گفتگوهایی است که طی سالیان دراز با آقای ملکیان انجام شده و در این مجلد گرد آمده است. در این کتاب، ۱۵ گفتگو راجع به موضوعات مختلف مثل معنابخشی به زندگی، فقه، هرمنوتیک قرآن، روشنفکری دینی، حاکمیت دینی و … وجود دارد.
عمر دوباره: درسگفتارهای در باب اخلاق کاربستی، نشر شور، ۱۳۹۷
در این کتاب، در قالب شش نشست، مجموعه‌ای دروس برای زندگی جاری و روزمره و اخلاقیات حاکم بر آن ارائه شده است. موضوع این کتاب، نه نظریات فلسفی اخلاق، بلکه اخلاق کاربردی یا کاربستی (applied ethics) است، یعنی اخلاقیاتی که به زندگی و موقعیت‌های مختلف آن توجه دارد.
شکوه جان آدمی: طرحی اجمالی و کلی از عدالت اجتماعی، انتشارات نگاه معاصر، ۱۴۰۲
در این رساله کوتاه به ابعاد مختلف مفهوم عدالت پرداخته شده است. در ابتدا به تعاریف مختلف واژه اشاره شده و سپس کسانی که باید با عدالت رفتار کنند نام برده شده. همینطور به ابعاد معرفتی عدالت نیز پرداخته شده است.
